De Abdij Tre Fontane werd gesticht zo rond het jaar 625 op een plek die bekend stond vanwege een nogal opvallende legende. Het is de plek waart de apostel Paulus in het jaar 67 werd onthoofd. Volgens de legende stuiterde zijn hoofd na de onthoofding drie keer op de grond, waarna op die exacte plaatsen drie waterbronnen (fonteinen) ontsproten. De plek was daaromheen bekend pelgrimsoord en derhalve een logische keuze van Paus Honorius om daar een klooster te stichten.

Het klooster werd bewoond door Griekse en Armeense monniken uit Cilicië (de geboorteregio van de apostel Paulus). Zij ontvluchtten destijds de islamitische oorlogen in het Oost-Romeinse Rijk.

In 1140 droeg Paus Innocentius II het kloostercomplex over aan de cisterciënzers en in 1868 bracht Paus Pius IX de trappisten, naar het klooster. Zij waren het die het gebied definitief wisten te ontginnen door grootschalige drainagesystemen aan te leggen én duizenden eucalyptusbomen te planten. De bomen onttrokken het vocht aan de moerassen en de harsachtige geur hield de muggen op afstand, wat de weg vrijmaakte voor het huidige, gezonde kloosterleven. De abdij is nog steeds omgeven door honderden eucalyptusbomen.

Tot 1808, toen de abdij, na de bezetting van de pauselijke staat door Napoleon, dicht moest en de monniken hun abdij moesten verlaten. Er volgden decennia van verwaarlozing maar in 1868 begon een nieuwe periode van bloei. De abdij werd bekend om de heerlijke honing, chocola, eucalyptuslikeur en een azijnachtig drankje dat goed zou helpen tegen hoofdpijn. Later ook vanwege het bier, want het zijn de trappisten die het klooster weer tot bloei wisten te brengen

Er wonen thans nog een tiental trappistenpaters in de abdij. Vanwege het teruglopende aantal nieuwe intredes wordt de abdij sinds 2021 ook bewoond door een gemeenschap trappistinnen.

Het complex is weliswaar omringd door een grote muur maar er is een toegangspoort en drie kerken en de kloostertuin met eucalyptusbomen zijn te bezoeken en bij de toegangspoort is een café en een abdijwinkel (Negozio Monastico) waar je trappistenproducten kunt kopen, zoals `Tre Fontane`, het trappistenbier van het klooster.

Het brouwen van het bier begon in 2014 in kleine hoeveelheden voor lokale verkoop onder de naam `Birra dei Monaci`. Ze gingen er voor in de leer bij collega trappisten van Orval en Rochefort.  In 2015 kregen ze het “Authentic Trappist” label en werd het bier omgedoopt tot Tre Fontane tripel. Voor de Tre Fontane tripel voegen de monniken tijdens het brouwen een extract van eucalyptusbladeren toe die het bier een aparte, maar niet overheersende, verfrissende smaak geven.. Naast de tripel is er nu ook Tre Fontane Scala Coeli, gebrouwen met toevoeging van sinaasappelschillen en de Tertia. De Tertia zal alleen in de abdijwinkel te koop zijn. Het bier is trouwens toch zeer beperkt verkrijgbaar, de hoeveelheid die gebrouwen wordt blijft voorlopig beperkt tot maximaal 2000 hectoliter per jaar ofwel zo'n 7000 flessen.